Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMBRP28336 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NMBRP28336 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMBRP28336 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMBRP28336 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMBRP28336 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMBRP28336 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMBRP28336 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMBRP28336 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMBRP28336 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMBRP28336 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMBRP28336 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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