Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXP28300 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXP28300 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXP28300 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LOXP28300 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXP28300 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms