Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB9P28065 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms