Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO2P25791 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO2P25791 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO2P25791 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO2P25791 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO2P25791 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO2P25791 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO2P25791 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms