Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMA3P25788 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms