Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK2P24941 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK2P24941 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK2P24941 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK2P24941 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK2P24941 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK2P24941 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK2P24941 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK2P24941 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK2P24941 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK2P24941 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK2P24941 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2P24941 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK2P24941 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK2P24941 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK2P24941 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK2P24941 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK2P24941 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK2P24941 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK2P24941 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK2P24941 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK2P24941 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK2P24941 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK2P24941 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK2P24941 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK2P24941 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms