Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRZ1P23471 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRZ1P23471 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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