Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRDP23468 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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