Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms