Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSPP15924 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSPP15924 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSPP15924 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSPP15924 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSPP15924 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms