Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms