Protein–RNA interactions for Protein: P13985

HRES1, Putative HTLV-1-related endogenous sequence, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRES1P13985 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HRES1P13985 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HRES1P13985 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HRES1P13985 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HRES1P13985 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HRES1P13985 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HRES1P13985 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HRES1P13985 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HRES1P13985 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HRES1P13985 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HRES1P13985 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms