Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VPREB1P12018 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms