Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD1P0DJD0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD1P0DJD0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms