Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIL1P09327 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIL1P09327 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIL1P09327 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIL1P09327 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms