Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACAA1P09110 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms