Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NGFRP08138 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NGFRP08138 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NGFRP08138 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NGFRP08138 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NGFRP08138 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NGFRP08138 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NGFRP08138 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms