Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL1O95922 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL1O95922 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms