Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D2O95562 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D2O95562 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D2O95562 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D2O95562 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D2O95562 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D2O95562 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D2O95562 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D2O95562 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms