Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms