Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNSO60931 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNSO60931 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNSO60931 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNSO60931 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNSO60931 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNSO60931 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms