Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAK2O60296 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAK2O60296 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms