Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DENRO43583 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DENRO43583 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DENRO43583 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DENRO43583 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms