Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms