Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms