Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC4-APOC2K7ER74 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC4-APOC2K7ER74 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms