Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVV-2B6SEH9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms