Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVV-1B6SEH8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-1B6SEH8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms