Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KNCNA6PVL3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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