Protein–RNA interactions for Protein: A6NKQ9

CGB1, Choriogonadotropin subunit beta variant 1, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB1A6NKQ9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CGB1A6NKQ9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CGB1A6NKQ9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CGB1A6NKQ9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CGB1A6NKQ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CGB1A6NKQ9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGB1A6NKQ9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CGB1A6NKQ9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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