Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA3AA6NCI4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms