Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF804BA4D1E1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF804BA4D1E1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms