Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND3A2RUS2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND3A2RUS2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms