Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEB3A0JP26 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms