Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FAM177A1P1-201ENST00000503598 473 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC091096.1-201ENST00000521955 614 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL355922.4-201ENST00000555642 449 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RIT2-202ENST00000589109 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZNF83-209ENST00000596930 560 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL133520.1-201ENST00000610430 700 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC123788.2-201ENST00000612290 283 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC074029.3-201ENST00000618623 312 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL022334.1-201ENST00000417397 1726 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZNF192P2-201ENST00000402215 1383 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ADH7-205ENST00000482593 1420 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC092979.1-201ENST00000488190 1414 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PCNAP3-201ENST00000397222 778 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL354732.1-204ENST00000421020 755 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FANK1-AS1-201ENST00000445458 428 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL391361.2-202ENST00000454826 439 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PIGFP1-201ENST00000519180 653 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC073167.1-201ENST00000559303 580 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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