Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC083902.2-201ENST00000511828 10086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 THAP12P6-201ENST00000431978 2310 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 DLG2-218ENST00000524982 2872 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 MYH8-201ENST00000403437 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 CLNK-201ENST00000226951 5599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ALDH1L2-201ENST00000258494 7547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 DENND2C-201ENST00000393274 6163 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PTPRMP28827 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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