Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HIST1H4F-201ENST00000244537 312 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PAGE5-203ENST00000374955 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RBMY2YP-201ENST00000423333 912 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP001342.1-201ENST00000423389 525 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL591438.2-201ENST00000452635 691 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC092569.1-201ENST00000455192 258 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RN7SL587P-201ENST00000459853 281 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC02058-201ENST00000507491 707 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 HEXB-205ENST00000509579 806 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PTK2-241ENST00000522950 548 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP002957.1-201ENST00000525952 406 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC243972.1-201ENST00000542992 570 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC079384.1-201ENST00000548506 600 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 GSTZ1-216ENST00000556627 919 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC243960.3-201ENST00000599316 580 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 EIF5P2-201ENST00000618904 1035 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 C18orf12-201ENST00000623329 537 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC114786.2-201ENST00000510090 1426 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SERPINB12-201ENST00000269491 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 VN1R13P-201ENST00000406212 885 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR4E2-201ENST00000408935 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC01865-202ENST00000436808 853 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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