Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC123768.2-201ENST00000500941 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC021106.2-201ENST00000505310 710 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP001124.1-201ENST00000529628 385 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 KHDC1-206ENST00000610330 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC103974.2-201ENST00000611319 778 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 PAX8-AS1-213ENST00000609210 1328 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 TSACC-202ENST00000368252 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL158168.1-201ENST00000443282 357 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP001767.2-201ENST00000527291 382 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC074032.1-202ENST00000552815 467 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RBM22P13-201ENST00000569805 1244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01515-207ENST00000598092 496 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AF146191.1-201ENST00000604941 889 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC239600.2-201ENST00000619615 1165 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 WDR11-AS1-207ENST00000630905 769 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RPL7P7-201ENST00000428803 703 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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