Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
C9orf40Q8IXQ3 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
C9orf40Q8IXQ3 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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