Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AL512604.2-201ENST00000426946 1314 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 SPIN2B-201ENST00000275988 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP72-201ENST00000362327 292 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL365295.1-204ENST00000425648 553 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01852-201ENST00000434223 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 P2RX6P-201ENST00000439119 468 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC104772.1-201ENST00000444764 862 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC034238.2-201ENST00000445660 567 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC026111.1-201ENST00000551090 1195 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 Z95115.1-202ENST00000565764 981 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 TTN-AS1-218ENST00000586452 828 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 TREM1-204ENST00000589614 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC00674-202ENST00000590734 160 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL354733.2-205ENST00000590813 621 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC016394.1-201ENST00000608444 833 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF132-203ENST00000639285 1200 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 BIN2P2-201ENST00000503900 1303 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 CASP8-208ENST00000392266 1283 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 SAP18P3-201ENST00000449663 396 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AL603839.3-201ENST00000450713 605 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
IFFO1Q0D2I5 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms