Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 THAP12P3-201ENST00000456373 2266 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC090539.2-201ENST00000523425 671 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL354719.2-201ENST00000429530 1454 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC018892.2-201ENST00000457656 693 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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