Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 PSMD10-203ENST00000340200 713 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC008770.1-201ENST00000406892 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RPL3P4-201ENST00000417615 423 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC108448.2-201ENST00000431546 730 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SMYD1-202ENST00000438570 680 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC018738.1-201ENST00000441378 210 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AP002856.4-201ENST00000441638 569 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC107983.1-201ENST00000442562 210 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AP003499.1-201ENST00000527217 574 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC023905.1-203ENST00000560180 765 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ULK4P3-201ENST00000563895 440 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AP001025.3-201ENST00000578787 864 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ZSCAN26-203ENST00000611552 1030 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC245033.3-201ENST00000617986 224 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC01778-208ENST00000635288 1095 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ERBB3-213ENST00000549832 3289 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SYNE1-206ENST00000367253 5189 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SLC6A2-206ENST00000567238 3160 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL365475.1-201ENST00000565135 1949 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 OCM-201ENST00000242104 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SERPINB12-201ENST00000269491 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC010983.1-201ENST00000418387 1028 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC006450.2-201ENST00000429482 581 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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