Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL627309.1-201ENST00000466430 2748 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 DGKG-202ENST00000344484 3445 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CXCR2P1-201ENST00000439871 2503 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 OR2T1-202ENST00000642005 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC005863.1-201ENST00000379640 2998 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms