Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCL17-202ENST00000616880 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073488.11-201ENST00000633298 754 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAG1-202ENST00000423799 1684 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNMD-201ENST00000373031 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCN1P1-201ENST00000372031 505 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004009.1-201ENST00000412413 567 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00424-201ENST00000413124 654 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABYR-205ENST00000415309 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GACAT1-201ENST00000419650 577 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC1A-203ENST00000420265 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104170.1-202ENST00000426017 362 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLNK-204ENST00000427367 1284 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL683807.1-201ENST00000427886 445 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359979.1-201ENST00000446145 487 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2P14-201ENST00000449657 628 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL6P1-201ENST00000449877 453 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104843.1-201ENST00000451203 319 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAM4-201ENST00000458128 765 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBBP4P2-201ENST00000478252 1264 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC19-205ENST00000479269 610 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRF2-AS1-201ENST00000505107 665 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NACA2-201ENST00000521764 777 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00678-201ENST00000527083 786 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00520-204ENST00000556417 778 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL405P-201ENST00000582502 289 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01926-201ENST00000589476 478 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM11B-201ENST00000612624 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013553.3-201ENST00000612943 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009093.6-201ENST00000622268 553 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CU638689.4-203ENST00000625185 785 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFI-207ENST00000618244 1345 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLRB1-201ENST00000229402 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APH1B-203ENST00000380343 685 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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