Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 LINC01132-201ENST00000437601 3793 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 TAAR9-201ENST00000434551 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 CREM-224ENST00000468236 582 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 LINC01747-203ENST00000634603 1377 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 TULP3P1-201ENST00000442322 816 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SGCZQ96LD1 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms