Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 DCN-207ENST00000546370 586 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ZNF174-205ENST00000575752 1068 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC012493.1-201ENST00000453252 760 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AP002383.5-201ENST00000542623 1161 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AP000436.1-201ENST00000605239 800 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms