Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR1DQ9Y2S0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms