Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11BQ9Y2G3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11BQ9Y2G3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms