Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA7Q9UN72 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA7Q9UN72 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA7Q9UN72 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA7Q9UN72 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms