Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRQQ9UMZ3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRQQ9UMZ3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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